Новые полиморфные микросателлитные локусы для Theobroma cacao: выделение и характеристика микросателлитов из обогащенных геномных библиотек
New polymorphic microsatellite loci for Theobroma cacao: isolation and characterization of microsatellites from enriched genomic libraries
E. S. L. Santos, D. Ahnert, C. B. M. Cerqueira-Silva, G. M. Mori, R. X. Corrêa, A. P. Souza
Аннотация (перевод)
Семнадцать полиморфных микросателлитных маркеров были выделены из обогащенных геномных библиотек для Theobroma cacao, предоставив дополнительные инструменты для изучения генетического разнообразия и насыщения карты этого вида. Эти маркеры были охарактеризованы в 32 образцах коллекции зародышевой плазмы T. cacao из Centro de Pesquisas do Cacau. Число аллелей в каждом локусе варьировало от 2 до 8, составляя в среднем 4.41 аллеля на локус. Информационное содержание полиморфизма варьировало от 0.060 до 0.695, составляя в среднем 0.333. Маркеры, охарактеризованные в этом исследовании, будут использоваться в исследованиях насыщения карты и оценках разнообразия генотипов какао
Оригинальная аннотация
Seventeen polymorphic microsatellite markers were isolated from enriched genomic libraries for Theobroma cacao, providing additional tools for studying the genetic diversity and map saturation of this species. These markers were characterized in 32 accessions of the T. cacao germplasm collection from the Centro de Pesquisas do Cacau. The number of alleles at each locus varied from 2 to 8, with an average of 4.41 alleles per locus. The polymorphism information content varied from 0.060 to 0.695, with an average of 0.333. The markers characterized in this study will be employed in map saturation studies and diversity assessments of cacao genotypes
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/094ed78c-f052-4b63-8c0d-d2e297aef5a3
DOI: 10.1007/s10535-012-0134-y