Генетическое картирование какао и идентификация QTL устойчивости к ведьминой метле
Cocoa genetic mapping and QTL identification to withes’ broom resistance
http://lattes.cnpq.br/9963384168622230, Ahnert, Dário, Barros, Everaldo Gonçalves de, Moreira, Maurilio Alves, Queiroz, Vagner Tebaldi de
aflp rapd ciências biológicas
Аннотация (перевод)
Потомство F2, состоящее из 82 особей, полученных от скрещивания Scavina-6 и ICS-1, было проанализировано с использованием молекулярных маркеров. Методы RAPD и AFLP амплифицировали 196 полиморфных фрагментов, распределенных по 26 группам сцепления. Эти маркеры охватывали рекомбинационное расстояние 1,733 cM со средним расстоянием 8.84 cM между двумя сцепленными маркерами. Простой и множественный регрессионный анализ, а также интервальное картирование использовались для идентификации и картирования геномных регионов, ассоциированных с устойчивостью к ведьминой метле. Доля фенотипической изменчивости, объясняемая каждым маркером, варьировала от 8.4% для локусов iacacac.261 до 12.7% для локусов sacgcat.78. Из шести маркеров, ассоциированных с устойчивостью к ведьминой метле при 1% вероятности, только маркеры iAE06.950, saggcat.108 и iAB09.464 были сохранены в модели множественной регрессии при использовании метода пошагового исключения. Три маркера вместе объясняли 27.8% фенотипической изменчивости. Анализ интервального картирования выявил значимые ассоциации в группах сцепления 01 и 11 при 5% вероятности. В группе сцепления 01 было идентифицировано три QTL, фланкированных маркерами iaagctc.65 - iBB12.1100, iAH18.850 - iBG09.580 и iAC01.475 - iAS19.970. Группа сцепления 11 показала два высокозначимых QTL (P < 0,01) между маркерами saggcat.108 - sAV14.940 и sAV18.590 - sZ04.500. Маркеры, идентифицированные с помощью множественного регрессионного анализа, были также обнаружены с помощью интервального картирования, за исключением маркера iAB09.464, который не был сцеплен на генетической карте, построенной в данной работе.
Оригинальная аннотация
An F2 progeny composed by 82 individuals derived from a cross between Scavina-6 and ICS-1 was analyzed using molecular markers. RAPD and AFLP techniques amplified 196 polymorphic fragments distributed along 26 linkage groups. These markers covered a recombination distance of 1,733 cM, with an average of 8.84 cM between two linked markers. Simple and multiple regression analysis, and interval mapping were used to identify and to map genomic regions associated with witches’ broom resistance. The proportion of phenotypic variation explained by each marker varied from 8.4%, for iacacac.261 loci, to 12.7%, for sacgcat.78 loci. Out of the six markers associated with witches’ broom resistance at 1% of probability, only the markers iAE06.950, saggcat.108 and iAB09.464 were mantained on the multiple regression model using the stepwise elimination method. The three markers explained together 27.8% of the phenotypic variation. Interval mapping analysis detected significative associations in the linkage groups 01 and 11 at 5% of probability. In the linkage group 01 were identified three QTLs, flanked by the markers iaagctc.65 - iBB12.1100, iAH18.850 - iBG09.580 and iAC01.475 - iAS19.970. The linkage group 11 showed two QTLs highly significant (P < 0,01) between the markers saggcat.108 - sAV14.940 and sAV18.590 - sZ04.500. Markers identified by multiple regression analysis were also detected by interval mapping, except for the marker iAB09.464 that were not linked on the genetic map performed in this work.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/6193e1aa-f0b7-4bfb-aa43-a2753f6387dc