Размер генома и полиморфизм ДНК в какао Theobroma
Genome Size and DNA Polymorphism in Theobroma cacao
Antônio Figueira, Jules Janick, Peter B. Goldsbrough
Аннотация (перевод)
Размер гаплоидного генома Theobroma cacao L. (какао), оценённый с помощью лазерной цитометрии, составлял 0,43 пг. Была разработана усовершенствованная процедура экстракции ДНК, основанная на выделении сырого препарата ядер из ткани листьев, что эффективно устраняло загрязнение ДНК полисахаридами и давало ДНК в среднем длиннее 50 кб. Выходы ДНК варьировались от 2 до 10 мкг·г - 1 свежего веса листовой ткани. Эксперименты по гибридизации блот ДНК с рибосомным зондом ДНК льна (Linum usitatissimum L.) выявили полиморфизмы длины рестриктивных фрагментов между тремя генотипами какао. Различия между ДНК этих генотипов также были обнаружены путём амплификации полиморфных фрагментов ДНК полимеразной цепной реакцией с использованием случайных олигонуклеотидных праймеров.
Оригинальная аннотация
The size of the haploid genome of Theobroma cacao L. (cacao), estimated using laser flow cytometry, was 0.43 pg. An improved DNA extraction procedure was developed based on isolation of a crude nuclei preparation from leaf tissue that effectively eliminated contamination of the DNA by polysaccharides and produced DNA that was, on average, longer than 50 kb. DNA yields ranged from 2 to 10 μg·g -1 fresh weight of leaf tissue. DNA blot hybridization experiments with a flax (Linum usitatissimum L.) ribosomal DNA probe revealed restriction fragment length polymorphisms between three cacao genotypes. Differences between the DNA of these genotypes were also detected by polymerase chain reaction amplification of polymorphic DNA fragments, using random oligonucleotide primers.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/654e7509-fb96-4a78-8d2b-514054fe655b
DOI: 10.21273/jashs.117.4.673
OpenAlex: W2185568772