Молекулярная характеристика Moniliophthora roreri, возбудителя монилиоза какао в трех провинциях Эквадора: Лос-Риос, Манаби и Санто-Доминго-де-лос-Тсачилас
Molecular characterization of Moniliophthora roreri, causative agent of moniliasis in cocoa in three provinces of Ecuador: Los Ríos, Manabi and Santo Domingo de los Tsáchilas
María de Lourdes Torres, Diana Mollocana, María Paula Erazo, Xamara Aguirre
Аннотация (перевод)
Какао (Theobroma cacao L) является одним из основных сельскохозяйственных продуктов Эквадора. Однако оно восприимчиво к болезням и вредителям, среди которых наиболее распространены поражения грибкового происхождения [1]. Черный стручок, вызываемый Phytophthora sp., «ведьмина метла», вызываемая Moniliophthora perniciosa, и монилиоз, вызываемый Moniliophthora roreri, являются наиболее часто регистрируемыми заболеваниями. Монилиоз считается наиболее разрушительным среди всех заболеваний, поражающих эту культуру [2]. M.roreri проявляется на плодах растения и имеет две фазы инфекции: биотрофную, при которой наблюдаются деформации плода, и некротическую, при которой происходят загнивание и гибель плода [3]. Массы спор отделяются от псевдостромы гриба и переносятся различными путями (ветром, людьми, животными и водой) [4]. Климатические условия и количество свободных спор являются определяющими факторами в жизненном цикле этого патогена [5]. Тем не менее гриб присутствует круглый год как компонент воздушного слоя в регионах выращивания, что затрудняет его искоренение. Более глубокие знания о генетическом разнообразии этого микроорганизма могут привести к лучшему пониманию механизмов его распространения и адаптации. Поскольку это заболевание наносит большой экономический ущерб, а исследований на молекулярном уровне проводилось немного, целью данного исследования была характеристика изолятов M. roreri для определения их генетического разнообразия. Для этого было взято 75 образцов гриба M. roreri из трех провинций Эквадора с высокой урожайностью какао. Нуклеотидное разнообразие определяли путем амплификации и секвенирования рибосомных регионов ITS1 и ITS2 каждого образца. Был выявлен низкий уровень генетической дифференциации между проанализированными образцами. Результаты анализа молекулярной дисперсии (AMOVA) показали, что большая часть генетической вариабельности обнаруживается внутри особей (71.29%). Для изучения филогенетических связей было построено дерево по алгоритму MCC с использованием последовательностей регионов ITS из образцов данного исследования совместно с другими континентальными последовательностями, ранее опубликованными в открытых базах данных (всего 42 образца). Примечательно, что после проведения филогенетического анализа было обнаружено, что Эквадор может являться центром происхождения M. roreri с многократными реинтродукциями патогена по всей Латинской Америке. Данные должны быть подтверждены дальнейшими исследованиями.
Оригинальная аннотация
Cocoa (Theobroma cacao L) is one of the main agricultural products of Ecuador. However, it is susceptible to diseases and pests being those of fungal origin, the most common [1]. Black sheath caused by Phytophthora sp., the witch's broom caused by Moniliophthora perniciosa, and moniliasis caused by Moniliophthora roreri are the most reported conditions. Moniliasis is considered the most destructive than all diseases that affect this crop [2]. M.roreri manifests itself on the cob of the plant and presents two phases of infection: the biotrophic where it can be seen malformations in the fruit, and the necrotic where rot and death of the fruit occur [3]. The spore masses break off the fungus pseudostroma and move by different mechanisms (wind, humans, animals, and water) [4]. The climatic conditions and the amount of free spores are determinants in the life cycle of this pathogen [5]. Nevertheless, the fungus is present during year-round as a component of the air layer in growing regions, making eradication difficult. A better knowledge of the genetic diversity of this microorganism could lead to a greater understanding of its distribution and adaptation mechanisms. Since this disease causes great economic losses, and there have been few studies of its molecular level, the objective of this investigation was the characterization of M. roreri isolates, to determinate its genetic diversity. To do this, 75 samples of the M. roreri fungus from three Ecuadorian provinces of high cocoa productivity were taken. Nucleotide diversity was determined through the amplification and sequencing of the ITS1 and ITS2 ribosomal regions of each sample. It was found a low level of genetic differentiation between the samples analyzed. The results of the molecular variance analysis (AMOVA) revealed that most of the genetic variability is found within individuals (71.29%). To study phylogenetic relationships, an MCC algorithm tree was made using the sequences of the ITS regions from the samples in this study, together with other continental sequences previously reported in public databases (42 samples in total). Interestingly, it was found after performing the phylogenetic analyzes that Ecuador could be the center of origin of M. roreri, with multiple reintroductions of the pathogen occurring throughout Latin America. Data should be corroborated with future research.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/77674b7f-e167-4241-8c66-8d25859b1fc4
DOI: 10.60692/85xte-ys926