Генетическая изменчивость в популяциях возбудителя увядания какао, Ceratocystis cacaofunesta
Genetic variation in populations of the cacao wilt pathogen, Ceratocystis cacaofunesta
Engelbrecht, C. J. B., Suarez, C., Alfenas, A. C., Harrington, T. C.
theobroma cacao
Аннотация (перевод)
Ceratocystis cacaofunesta (= Ceratocystis fimbriata) вызывает летальное увядание какао (Theobroma cacao) в Латинской Америке. Полиморфные микросателлитные маркеры, фингерпринты ядерной ДНК (CAT)5 и фингерпринты митохондриальной ДНК Hae III использовались для сравнения генетического разнообразия среди изолятов C. cacaofunesta, собранных из популяций в западном Эквадоре, Коста-Рике, Колумбии, а также Рондонии и Баие в Бразилии. Микросателлитные маркеры и фингерпринты ядерной ДНК отделили эквадорские изоляты от изолятов остальных четырех популяций, и эти две основные группы соответствуют генетическим линиям, ранее идентифицированным по последовательностям ITS‐rDNA и группам интерстерильности. Фингерпринты митохондриальной ДНК также продемонстрировали существенное разнообразие и разделили эквадорские изоляты на две группы. Все типы маркеров показали ограниченную вариабельность в колумбийской, коста-риканской и баиянской популяциях, как и следовало ожидать для интродуцированных популяций, прошедших через недавние генетические «бутылочные горлышки». Напротив, популяции из Рондонии и западного Эквадора продемонстрировали значения генного разнообразия, сходные с природными популяциями других видов Ceratocystis. Популяция из Рондонии была единственной исследованной популяцией в пределах естественного ареала T. cacao (Верхняя Амазонка), и предположительно интродуцированные популяции оказались более тесно связаны с популяцией из Рондонии, чем с популяцией из западного Эквадора. Эквадорская популяция находится в ареале произрастания других местных видов Theobroma, которые могут служить естественными хозяевами.
Оригинальная аннотация
Ceratocystis cacaofunesta (= Ceratocystis fimbriata) causes a lethal wilt disease of cacao (Theobroma cacao) in Latin America. Polymorphic microsatellite markers, (CAT)5 nuclear DNA fingerprints and Hae III mitochondrial DNA fingerprints were used to compare genetic diversity among isolates of C. cacaofunesta collected from populations in western Ecuador, Costa Rica, Colombia, and Rondônia and Bahia in Brazil. Microsatellite markers and nuclear DNA fingerprints separated Ecuadorian isolates from isolates of the other four populations, and these two major groups correspond to genetic lineages already identified from ITS‐rDNA sequences and intersterility groupings. Mitochondrial DNA fingerprints also demonstrated substantial diversity and split the Ecuadorian isolates into two groups. All marker types showed limited variation in the Colombian, Costa Rican and Bahian populations, as might be expected for introduced populations that have gone through recent genetic bottlenecks. In contrast, the Rondonian and western Ecuadorian populations showed gene diversity values similar to natural populations of other Ceratocystis species. The Rondonian population was the only sampled population in the native range of T. cacao (the Upper Amazon), and the putatively introduced populations were more closely related to the Rondonian population than to the western Ecuadorian population. The Ecuadorian population is in an area with other native Theobroma species, which may serve as natural hosts.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/9e3fbb9c-9a13-48c2-a7dc-df39cfcfc5fb
DOI: 10.1111/j.1365-3059.2007.01735.x