Геном какао Theobroma
The genome of Theobroma cacao
Xavier Argout, Jérôme Salse, Jean‐Marc Aury, Mark J. Guiltinan, Gaëtan Droc, Jérôme Gouzy, Mathilde Allègre, Cristian Chaparro, Thierry Legavre, Siela N. Maximova, Michaël Abrouk, Florent Murat, Olivier Fouet, Julie Poulain, Manuel Ruíz, Yolande Roguet, Maguy Rodier-Goud, José Fernandes Barbosa-Neto, François Sabot, Dave Kudrna, Jetty S. S. Ammiraju, Stephan C. Schuster, John E. Carlson, Erika Sallet, Thomas Schiex, Anne Diévart, Melissa Kramer, Laura Gelley, Zi Shi, Aurélie Bérard, Christopher Viot, Michel Boccara, Ange Marie Risterucci, Valentin Guignon, Xavier Sabau, Michael J. Axtell, Zhaorong Ma, Yufan Zhang, Spencer C. Brown, Mickaël Bourge, Wolfgang Golser, Xiang Song, Didier Clément, Ronan Rivallan, G.Mathias Tahi, Joseph Moroh Akaza, Bertrand Pitollat, Karina Peres Gramacho, Angélique D'Hont, Dominique Brunel, Diógenes Infante, Ismael S. Kébé, Pierre Costet, Rod A. Wing, W. Richard McCombie, Emmanuel Guiderdoni, Françis Quétier, Olivier Panaud, Patrick Wincker, Stéphanie Bocs, Claire Lanaud
Аннотация (перевод)
Ксавье Аргу и коллеги сообщают о проекте генома какао Theobroma — тропической культуры, которая является источником шоколада. Сборка последовательностей охватывает примерно 80% генома. Мы секвенировали и собрали чернечный геном какао Theobroma — экономически важной культуры тропических фруктов, которая является источником шоколада. Эта сборка соответствует 76% от предполагаемого размера генома и содержит почти все ранее описанные гены, при этом 82% из них закреплены на хромосомах 10 T. cacao. Анализ этой информации о последовательности выявил специфическое расширение некоторых семейств генов в ходе эволюции, например, генов, связанных с флавоноидами. Он также является основным источником кандидатов в гены для улучшения уровня T. cacao. Основываясь на предполагаемой палеоистории генома T. cacao, мы предлагаем эволюционный сценарий, согласно которому десять хромосом T. cacao были сформированы из предка через одиннадцать слияний хромосом.
Оригинальная аннотация
Xavier Argout and colleagues report the draft genome of Theobroma cacao, the tropical crop that is the source of chocolate. The sequence assembly covers approximately 80% of the genome. We sequenced and assembled the draft genome of Theobroma cacao, an economically important tropical-fruit tree crop that is the source of chocolate. This assembly corresponds to 76% of the estimated genome size and contains almost all previously described genes, with 82% of these genes anchored on the 10 T. cacao chromosomes. Analysis of this sequence information highlighted specific expansion of some gene families during evolution, for example, flavonoid-related genes. It also provides a major source of candidate genes for T. cacao improvement. Based on the inferred paleohistory of the T. cacao genome, we propose an evolutionary scenario whereby the ten T. cacao chromosomes were shaped from an ancestor through eleven chromosome fusions.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/b4afb423-2e14-404e-902b-90dbffd05989
DOI: 10.1038/ng.736
OpenAlex: W2092779913