Разработка микросателлитов для возбудителя монилиоза какао, Moniliophthora roreri
Development of microsatellites for the cacao frosty pod rot pathogen, Moniliophthora roreri
Santos, R. M. F., Suarez, C., Melo, B. L. B., Rehner, S. A., Solis, K. H., Hebbar, P. K., Lemos, L. S. L., Souza, J. T. de, Gramacho, K. P.
Аннотация (перевод)
Moniliophithora roreri, возбудитель монилиоза какао, считается одним из самых разрушительных патогенов этой культуры. В данном исследовании мы сообщаем о разработке и валидации 28 микросателлитных локусов из обогащенной библиотеки. Было показано, что десять из этих локусов полиморфны в эквадорской популяции, состоящей из 27 изолятов. Среднее число аллелей на локус составило 3.2, а наблюдаемая средняя и ожидаемая гетерозиготность составили 0.03 и 0.43 соответственно. Описанные здесь полиморфные микросателлиты могут быть использованы для изучения генетического разнообразия, а также для понимания других аспектов популяционной биологии M. roreri.
Оригинальная аннотация
Moniliophithora roreri, causal agent of cacao frosty pod rot, is considered one of the most devastating pathogens of this crop. In this study, we report the development of and validation of 28 microsatellite loci from an enriched library. From these, ten loci were demonstrated to be polymorphic in an Ecuadorian population composed of 27 isolates. The mean number of alleles per locus was 3.2, and the observed mean and expected heterozygosity were 0.03 and 0.43, respectively. The polymorphic microsatellites described herein may be used to study the genetic diversity as well as to comprehend other aspects of M. roreri population biology.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/c65da3e6-1ab4-4180-b1a8-2cd659447031
DOI: 10.1111/efp.12103