Аборигенные кадмий-толерантные Trichoderma, ассоциированные с ризосферой Inga sp. и Quararibea sp. в амазонских какао-агроэкосистемах Перу
Native Cadmium-Tolerant Trichoderma Associated with the Rhizosphere of Inga sp. and Quararibea sp. in Amazonian Cocoa Agroecosystems of Peru
Jessenia Shirley Ramos Armaulia, Lizette Méndez Fasabi, Santos Leiva, Manuel Oliva
Аннотация (перевод)
Загрязнение кадмием (Cd) почв амазонских плантаций какао угрожает производству Theobroma cacao, а ризосфера теневых деревьев может содержать Cd-толерантные грибы, полезные для биоремедиации. Trichoderma, ассоциированные с Quararibea sp., остаются неизученными. Мы выделили аборигенные Trichoderma из ризосфер Inga sp. и Quararibea sp. в Bagua (Peru) и оценили толерантность к Cd (25–200 ppm) по проценту ингибирования роста (GIP) и IC50 на основе моделей «доза–эффект», выбранных с помощью информационного критерия Акаике (AIC). Из 16 Trichoderma-подобных изолятов пять соответствовали строгим мультилокусным критериям качества: JSRA09 (Quararibea sp.) и JSRA16, JSRA22, JSRA28, JSRA30 (Inga sp.). Независимые деревья максимального правдоподобия (ITS, tef1, rpb2) отнесли JSRA09 к кладе T. spirale/T. subuliforme, JSRA16 — к комплексу T. harzianum (сходство с T. lentiforme), JSRA22 и JSRA28 — к кладе внутри комплекса T. koningii/T. koningiopsis, а JSRA30 — к T. afroharzianum. Насколько нам известно, JSRA09 представляет собой первое сообщение о Trichoderma у Quararibea sp. Ни один штамм не превысил 35% ингибирования при 200 ppm: JSRA09 и JSRA16 были высокотолерантными (GIP < 10%), JSRA28 и JSRA30 — умеренно толерантными, а JSRA22 — толерантным. Отбор по AIC выявил линейные зависимости для JSRA09 и JSRA16 и лог-логистические (LL.4) — для JSRA22, JSRA28 и JSRA30. Эти аборигенные штаммы являются кандидатами для дальнейшего скрининга с целью создания микробных консорциумов для биоремедиации Cd.
Оригинальная аннотация
Cadmium (Cd) contamination of Amazonian cocoa soils threatens Theobroma cacao production, and shade-tree rhizospheres may harbour Cd-tolerant fungi useful for bioremediation. Trichoderma associated with Quararibea sp. remain unexplored. We isolated native Trichoderma from rhizospheres of Inga sp. and Quararibea sp. in Bagua (Peru), and evaluated Cd tolerance (25–200 ppm) through growth inhibition percentage (GIP) and IC50 from dose–response models selected via the Akaike Information Criterion (AIC). Of 16 Trichoderma-like isolates, five met stringent multilocus quality criteria: JSRA09 (Quararibea sp.) and JSRA16, JSRA22, JSRA28, JSRA30 (Inga sp.). Independent Maximum Likelihood trees (ITS, tef1, rpb2) assigned JSRA09 to the T. spirale/T. subuliforme clade, JSRA16 to the T. harzianum complex (affinity to T. lentiforme), JSRA22 and JSRA28 to a clade within the T. koningii/T. koningiopsis complex, and JSRA30 to T. afroharzianum. To the best of our knowledge, JSRA09 represents the first Trichoderma report in Quararibea sp. No strain exceeded 35% inhibition at 200 ppm: JSRA09 and JSRA16 were highly tolerant (GIP < 10%), JSRA28 and JSRA30 moderately tolerant, and JSRA22 tolerant. AIC selection yielded linear responses for JSRA09 and JSRA16, log-logistic (LL.4) for JSRA22, JSRA28 and JSRA30. These native strains are candidates for further screening towards microbial consortia for Cd bioremediation.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/e2ce6df6-57d4-47c8-bb27-53263308b556
DOI: 10.3390/jof12090644
OpenAlex: W7204933049