Виды оомицетов, ассоциированные с плантациями Theobroma cacao в Колумбии
Oomycete species associated with Theobroma cacao crops in Colombia
Ramírez Martínez J, Cárdenas Toquica M, Guevara‐Suarez M, Duarte D, Victorino Jimenez LD, Argüello Bernal BK, Gutiérrez Rodríguez E, Restrepo Restrepo S
Аннотация (перевод)
Изучение оомицетов, ассоциированных с сельскохозяйственными культурами, имеет огромное значение из-за экономических потерь, которые они могут вызывать. У какао род Phytophthora был подробно изучен, однако мало что известно о других родах и видах оомицетов, ассоциированных с этим растением. Целью данного исследования было определение разнообразия оомицетов, присутствующих на плантациях какао в Колумбии. Всего из больных растений и почвы в 11 департаментах было получено 146 изолятов. Был проведен анализ последовательностей внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) и субъединицы I цитохромоксидазы (coxI) наряду с оценкой морфологических характеристик. Было идентифицировано девять видов, распределенных по четырем родам: Phytophthora (P. palmivora, 54%; P. nicotianae, 1%), Phytopythium (Phy. chamaehyphon, 15%; Phy. cucurbitacearum, 9%; Phy. vexans, 7%; Phy. helicoides, 1%), Globisporangium (G. splendens, 3%) и Pythium (Py. delicense, 1%; Py. inflatum,1%). Кроме того, были обнаружены неидентифицированный и, возможно, новый вид Phytophthora (5%) и три неидентифицированных вида Phytopythium (3%). Это первое сообщение о Globisporangium, Phytopythium и Pythium на плантациях какао в Колумбии и первое сообщение о виде Phy. chamaehyphon в этой стране. Интересно, что некоторые изоляты Phytopythium spp. были выделены из некротизированных листьев и сосудистых срезов стеблей, что может указывать на их роль в болезнях какао, традиционно связываемых с Phytophthora. Также предполагается, что новый вид Phytophthora может вносить существенный вклад в развитие черной гнили плодов (black pod disease) на плантациях какао в Колумбии, и мы подчеркиваем, что изучение P. palmivora является неотложной задачей из-за его распространения по всей стране.
Оригинальная аннотация
The study of oomycetes associated with crops is highly important due to the economic losses they might cause. In cacao, the genus Phytophthora has been extensively studied, but little is known about other genera and species of oomycetes associated with this plant. This study aimed to determine the oomycetes’ diversity present in Colombian cacao crops. A total of 146 isolates were obtained from diseased plants and soil in 11 departments. Analysis of internal transcribed spacer (ITS) and cytochrome oxidase subunit I (coxI) sequences was performed along with the assessment of morphological characteristics. Nine species were identified, distributed in four genera: Phytophthora (P. palmivora, 54%; P. nicotianae, 1%), Phytopythium (Phy. chamaehyphon, 15%; Phy. cucurbitacearum, 9%; Phy. vexans, 7%; Phy. helicoides, 1%), Globisporangium (G. splendens, 3%), and Pythium (Py. delicense, 1%; Py. inflatum,1%). Additionally, an unidentified and possibly new species of Phytophthora (5%) and three unidentified species of Phytopythium (3%) were found. This is the first report of Globisporangium, Phytopythium, and Pythium in cacao crops of Colombia and the first report of the species Phy. chamaehyphon in the country. Interestingly, some isolates of Phytopythium spp. were isolated from necrotic leaves and vascular section of stems, which may suggest a role in cacao diseases traditionally associated with Phytophthora. Also, it is proposed that the new species of Phytophthora may be contributing significantly to black pod disease in Colombian cacao crops, and we highlight that the study of P. palmivora is urgent because of its distribution all over the country.
Идентификаторы
Canonical: https://research.holos.house/w/f63b63f0-a1c8-4c69-bccf-20354cc8ce47